发酵过程中产桔霉素较为普遍

产生青霉素的菌种很多，其中最为经典的是青霉属真菌Penicillium chrysogenum。这种真菌在发酵过程中，会产生一个叫做β-内酰胺酶的酶，这种酶能够分解β-内酰胺型抗生素。这个酶是保护这种真菌不受β-内酰胺型抗生素的攻击。

在发酵过程中，青霉属真菌会产生一个叫做初始生物合成途径的化合物，这种化合物能够转化成青霉素。该青霉素结构中的一个部分叫做丝氨酸，它的存在使得这种抗生素能够对β-内酰胺型菌株产生毒性作用。

除了青霉素外，产生其他类别的抗生素也很普遍，如链霉素、泽宁霉素等。这些抗生素的产生与菌株的品种、培养基、发酵条件等因素有关。